论文:Automatic Polygon Layout for Primal-Dual Visualization of Hypergraphs

作者:Botong Qu, Eugene Zhang, and Yue Zhang

发表:VIS 2021

N-元关系通常使用多边形表示。基于手动调整的方法能获得不错的布局效果,但是耗时耗力。为了自动生成高质量的以多边形为超节点的图布局,本文基于能量最小化的思路定义了一系列原则和优化算法。通过与三种传统方法的对比用户实验,验证了本方法在效率和准确率上有显著优势。此外,本文还同时考虑了对偶图的优化,帮助用户加速完成特定任务。

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背景介绍

  • 超图数据

    • 节点:$𝑉={𝑣1,𝑣_2,…,𝑣{|𝑉|} }$

    • 超边:$𝑅=𝑅1 \cup 𝑅_2 \cup … \cup 𝑅{|𝑉|} $,其中
      $𝑅_𝑘$ 表示连接$𝒌$个节点的超边的集合

  • 通常使用多边形表示超边
  • 动机:直观展示每个多边形也就是超边所连接节点的数量。

相关工作

  • Euler and Venn Diagrams
  • Matrix-based techniques
  • Subset-based approach
  • MetroMap
  • Bipartite graphs

方法

  • 定义设计原则*8
  • 定义优化方案
    • 定义了能量模型*4
    • 如何最小化能量
  • 支持原始-对偶视图
    • 联合优化

设计原则

1、每个多边形尽可能规则

2、基数越大,多边形的面积也越大
3、基数相同的多边形的面积也接近

4、多边形不应包含自重叠和翻折

5、避免多边形之间的不必要重叠

6、若两个多边形有3个以上公共点,则交集的形状应尽可能规则

7、节点间不应重叠
8、节点不应出现在它不属于的多边形的边上和内部

能量定义

  • 能量1:多边形规则能量(PRegular):使每个多边形尽可能接近正多边形(原则1)
  • 能量2:多边形面积能量(PArea):面积与边长的平方成正比(原则2);保证所有的边长尽可能一致(原则3)
  • 能量3:多边形分离能量(PSeperation):结合欧氏距离和余弦距离(原则5、7、8)
  • 能量4:多边形相交能量(PIntersection):使公共点序列分布尽可能均匀(原则6)

总能量 = PRegular + PArea + PSeperation + PIntersection

最小化过程

  • Step1:微调节点位置:L-BFGS梯度下降
  • Step2:点对交换:星形化(原则4)
  • 重复Step1、2

原始对偶视图

对偶图:点边互换
支持原始图和对偶图联合优化

性能

  • 时间复杂度:$\omega((|𝑉|+|𝑅|)^4 )$
  • 数据集
    • 最小数据集:76节点 + 26超边
      • 仅优化原始视图:0.25s
      • 联合优化原始-对偶视图:1.37s
    • 最大数据集:527节点 + 232超边
      • 仅优化原始视图:181.69s
      • 联合优化原始-对偶视图:268.82s
  • 实验环境
    • Inter Xeon E-2124G CPU @ 3.4GHz + 64GB RAM

用户实验

  • 用户数:21
  • 人造数据集
    • 12篇论文 + 36作者
    • 95篇论文 + 219作者
  • 目标
    • 对比本工作与三种现有方法(仅原始视图)
    • 统计用户计数作者所发表论文数量的正确率
    • 统计用户正确计数的速度

总结

  • 缺点

    • 时间复杂度太高 -> 对层次化的图数据布局
    • 能量间有冲突,可能部分失效
    • 多边形重叠有时处理不好
    • 未考虑标签布局问题
  • 优点

    • 干净的算法文章,行文流畅
    • 评估全面:性能分析+用户实验+案例分析
  • 启发
    • 扬长避短:评估时承认性能问题,但重心放在效果上
    • 自圆其说:提出的8个设计原则在算法设计和优化中均得以满足
    • 文章结构:套路成熟,值得借鉴


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